Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRXP46100 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRXP46100 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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