Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms