Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms