Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms