Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA3P35244 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms