Protein–RNA interactions for Protein: P32927

CSF2RB, Cytokine receptor common subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RBP32927 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2RBP32927 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms