Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCAP28676 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCAP28676 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCAP28676 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCAP28676 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCAP28676 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCAP28676 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCAP28676 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCAP28676 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCAP28676 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCAP28676 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCAP28676 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCAP28676 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GCAP28676 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCAP28676 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCAP28676 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCAP28676 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCAP28676 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms