Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms