Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA6P23229 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms