Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT1P21579 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT1P21579 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT1P21579 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT1P21579 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms