Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CXCL2P19875 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CXCL2P19875 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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