Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SPI1P17947 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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SPI1P17947 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPI1P17947 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPI1P17947 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPI1P17947 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SPI1P17947 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SPI1P17947 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SPI1P17947 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPI1P17947 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SPI1P17947 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SPI1P17947 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SPI1P17947 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPI1P17947 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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