Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYN1P17600 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYN1P17600 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYN1P17600 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYN1P17600 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYN1P17600 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYN1P17600 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYN1P17600 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYN1P17600 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYN1P17600 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYN1P17600 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYN1P17600 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYN1P17600 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYN1P17600 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYN1P17600 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYN1P17600 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYN1P17600 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYN1P17600 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYN1P17600 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYN1P17600 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYN1P17600 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYN1P17600 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYN1P17600 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYN1P17600 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYN1P17600 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYN1P17600 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYN1P17600 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms