Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCAP17252 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCAP17252 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCAP17252 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCAP17252 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCAP17252 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCAP17252 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCAP17252 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCAP17252 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCAP17252 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms