Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms