Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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