Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB4P16144 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms