Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME1P15531 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME1P15531 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME1P15531 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME1P15531 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME1P15531 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME1P15531 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME1P15531 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME1P15531 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME1P15531 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME1P15531 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms