Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms