Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH1P12830 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH1P12830 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH1P12830 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH1P12830 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH1P12830 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH1P12830 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH1P12830 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH1P12830 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH1P12830 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH1P12830 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH1P12830 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH1P12830 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH1P12830 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH1P12830 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms