Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms