Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms