Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms