Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBP07199 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBP07199 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms