Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLBP06746 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLBP06746 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLBP06746 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLBP06746 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLBP06746 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLBP06746 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLBP06746 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLBP06746 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLBP06746 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLBP06746 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLBP06746 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLBP06746 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLBP06746 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLBP06746 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLBP06746 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLBP06746 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLBP06746 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLBP06746 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLBP06746 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLBP06746 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
POLBP06746 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLBP06746 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLBP06746 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLBP06746 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLBP06746 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLBP06746 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLBP06746 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLBP06746 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLBP06746 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLBP06746 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLBP06746 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLBP06746 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLBP06746 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLBP06746 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLBP06746 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLBP06746 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLBP06746 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLBP06746 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms