Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms