Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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