Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
E2F6O75461 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
E2F6O75461 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms