Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms