Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms