Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNPHO15079 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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