Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1374.9 ms