Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms