Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
E9PBE3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
E9PBE3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms