Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms