Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms