Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX2A2RU54 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms