Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms