Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms