Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms