Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms