Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF6Q9Y252 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms