Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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