Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PADI1Q9ULC6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PADI1Q9ULC6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PADI1Q9ULC6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PADI1Q9ULC6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PADI1Q9ULC6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PADI1Q9ULC6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PADI1Q9ULC6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PADI1Q9ULC6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PADI1Q9ULC6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PADI1Q9ULC6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms