Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms