Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms