Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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