Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms