Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms