Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf109Q9NX04 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms